El siguiente script en bash une los ficheros: 0.pdf 1.pdf 2.pdf … 15.pdf en otro llamado todo.pdf

gedit pdfjoin.sh
====================inicio fichero
s=»»

for i in $(ls *.pdf);do
   s=${s}» «${i}
done

echo «pdftk ${s} cat output todo.pdf»
pdftk ${s} cat output todo.pdf
==================fin fichero

Se lanzaria desde la terminal con:
sh pdfjoin.sh